Senopati Pamungkas jilid 1 menceritakan kemenangan gemilang Raden Sanggrama Wijaya atas pasukan Tartar mengantarkannya ke tahta Keraton Majapahit.
Jilid 2 menceritakan Halayudha berhasil mengubur Gendhuk Tri dalam satu liang bersama Naga Nareswara. Sementara Upasara Wulung berusaha menemukan ketenteraman hati di rumah kediaman Pak Toikromo, penduduk desa yang begitu lugu ingin mengangkat upasara sebagai menantu.
Jilid 3 menceritaka eyang putri Pulangsih yang diperebutkan para ksatria lima puluh tahun lalu muncul kembali.
Menceritakan Gendhuk Tri merunut dan menemukan perahu kayu yang bersimbulkan Taring Naga Bermahkota yang merupakan tempat mempertahankan kehormatan terakhir.
Buku 5 menceritakan puncak pertarungan yang melibatkan Gemuka, Ratu Ayu Bawah Langit, Kiai Sambartaka, Upasara Wulung, yang lebih mengerikan.